202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0480 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  77.9 
 
 		 448 aa  738    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  100 
 
 		 448 aa  926    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  77.23 
 
 		 448 aa  739    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  77.68 
 
 		 448 aa  734    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  62.58 
 
 		 450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  61.02 
 
 		 448 aa  569  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  59.91 
 
 		 446 aa  549  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  56.79 
 
 		 448 aa  528  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  56.47 
 
 		 451 aa  528  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  55.58 
 
 		 498 aa  495  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  45.23 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 		 447 aa  344  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  41.74 
 
 		 462 aa  336  5.999999999999999e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  38.39 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  40.32 
 
 		 470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  25.82 
 
 		 501 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  26.5 
 
 		 500 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  26.28 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 509 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  25.85 
 
 		 500 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  26.07 
 
 		 500 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  26.07 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  26.07 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  26.07 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  26.07 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  25.85 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  26.07 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  25.72 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  25.72 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  25.22 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 508 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  23.25 
 
 		 498 aa  86.3  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  25.43 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  24.29 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  24.85 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12867  malate:quinone oxidoreductase  24.62 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000016519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  23.86 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  23.14 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2400  malate/quinone oxidoreductase  24.18 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514412  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  23.16 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  25.98 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  23.59 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  25.83 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  25.83 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2132  malate/quinone oxidoreductase  24.78 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  23.36 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  24.24 
 
 		 548 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  24.34 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  25.89 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  23.62 
 
 		 518 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04171  malate:quinone oxidoreductase  22.12 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  25.89 
 
 		 553 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  25.89 
 
 		 553 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0370  malate:quinone oxidoreductase  23.33 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  24.02 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 548 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  25.35 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  24.73 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  25.18 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  22.37 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  25.71 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  25.18 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  24.73 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  23.03 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  24.38 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  23.58 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  23.03 
 
 		 507 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  25.09 
 
 		 553 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  23.11 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  24.84 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  23.97 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  24.84 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  24.84 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  25.44 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  23.49 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  22.89 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  24.82 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  24.82 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  24.91 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0797  malate:quinone oxidoreductase  22.41 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.64083  normal  0.0315045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  24.46 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  24.56 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  22.84 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  23.38 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  23.21 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  22.84 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>