143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1955 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  100 
 
 		 492 aa  1013    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  61.99 
 
 		 500 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  61.99 
 
 		 500 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  61.99 
 
 		 500 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  61.99 
 
 		 500 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  61.99 
 
 		 500 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  61.99 
 
 		 500 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  62.2 
 
 		 500 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  62.2 
 
 		 500 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  60.77 
 
 		 509 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  79.67 
 
 		 492 aa  838    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  79.67 
 
 		 492 aa  838    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  63.82 
 
 		 500 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  62.2 
 
 		 500 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  61.79 
 
 		 500 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  59.76 
 
 		 501 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  56.58 
 
 		 519 aa  595  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  56.49 
 
 		 498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  56.33 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  53.39 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  53.85 
 
 		 497 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  54.29 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  56.08 
 
 		 526 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  53.27 
 
 		 500 aa  548  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  54.73 
 
 		 497 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  52.89 
 
 		 510 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  54.87 
 
 		 508 aa  538  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  55.25 
 
 		 523 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  55.67 
 
 		 523 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  53.69 
 
 		 539 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  52.77 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  50.71 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1698  malate/quinone oxidoreductase  52.07 
 
 		 498 aa  535  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0112426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2132  malate/quinone oxidoreductase  51.98 
 
 		 508 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  50.83 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  52.77 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  52.57 
 
 		 548 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  53.77 
 
 		 502 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  52.77 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  51.22 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  51.43 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  51.22 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  51.22 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  52.77 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  52.77 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  52.77 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  53.28 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  51.72 
 
 		 540 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  50.42 
 
 		 517 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  52.26 
 
 		 494 aa  525  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  51.43 
 
 		 498 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2629  malate:quinone oxidoreductase  51.44 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.765647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2683  malate:quinone oxidoreductase  51.44 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  53.07 
 
 		 548 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  51.22 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  52.57 
 
 		 548 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  50.71 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  51.66 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0011  malate:quinone oxidoreductase  51.03 
 
 		 492 aa  521  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  51.66 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 492 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  52.33 
 
 		 493 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3250  malate/quinone oxidoreductase  48.35 
 
 		 497 aa  524  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  50.71 
 
 		 501 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  52.3 
 
 		 502 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  52.09 
 
 		 502 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  49.69 
 
 		 508 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  49.49 
 
 		 494 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  49.9 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  50.71 
 
 		 502 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  52.49 
 
 		 525 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  51.24 
 
 		 502 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  53.08 
 
 		 560 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  48.06 
 
 		 493 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  51.66 
 
 		 521 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  52.98 
 
 		 545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  53.08 
 
 		 547 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  50.74 
 
 		 553 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  53.09 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  49.9 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  51.77 
 
 		 561 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  53.29 
 
 		 545 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  51.75 
 
 		 523 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  52.87 
 
 		 545 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  52.55 
 
 		 545 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  49.28 
 
 		 494 aa  511  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  52.02 
 
 		 553 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  52.44 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  52.44 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  52.13 
 
 		 552 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  52.02 
 
 		 547 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  50.74 
 
 		 488 aa  508  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  51.16 
 
 		 551 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4340  malate:quinone oxidoreductase  52 
 
 		 571 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  50.91 
 
 		 527 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  50.3 
 
 		 527 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1908  malate/quinone oxidoreductase  47.53 
 
 		 495 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.266658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12867  malate:quinone oxidoreductase  48.77 
 
 		 493 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000016519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  51.48 
 
 		 576 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  48.37 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>