257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1873 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 446 aa  924    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  58.39 
 
 		 446 aa  524  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  52.81 
 
 		 455 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  54.12 
 
 		 450 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  54.91 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  53.9 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  54.79 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  54.57 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  54.79 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  53.5 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  52.56 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  53.35 
 
 		 451 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  50.34 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  42.73 
 
 		 446 aa  349  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 447 aa  348  9e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04171  malate:quinone oxidoreductase  25.73 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  25.54 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.36 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  25.34 
 
 		 501 aa  93.2  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  24.33 
 
 		 519 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  26.99 
 
 		 519 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  26.68 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  25.6 
 
 		 509 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  25.6 
 
 		 498 aa  90.5  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  25.62 
 
 		 397 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 407 aa  89.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.03 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  22.91 
 
 		 548 aa  87.8  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  22.69 
 
 		 548 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  22.69 
 
 		 548 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  22.69 
 
 		 548 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  22.69 
 
 		 548 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  22.69 
 
 		 548 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  22.69 
 
 		 548 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  22.69 
 
 		 548 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  22.69 
 
 		 548 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 400 aa  86.7  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 396 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  24.82 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  22.81 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04801  malate:quinone oxidoreductase  23.43 
 
 		 497 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04721  malate:quinone oxidoreductase  23.41 
 
 		 508 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  24.62 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1753  malate:quinone oxidoreductase  22.95 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  24.61 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  24.22 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  25.35 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  24.67 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  25.22 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  24.67 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 500 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04391  malate:quinone oxidoreductase  22.57 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  23.11 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04701  malate:quinone oxidoreductase  22.8 
 
 		 498 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.621872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  24.44 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  24.44 
 
 		 545 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  24.48 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  24.62 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  23.56 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 		 527 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  24.73 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  24.51 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0370  malate:quinone oxidoreductase  23.87 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  24.73 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  27.89 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  25.44 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  25.43 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  25.39 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  23.13 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  23.73 
 
 		 551 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  25.65 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  24.62 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  23.32 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  25.61 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  21.86 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  23.62 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  23.21 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>