249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0428 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  74.03 
 
 		 462 aa  681    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 470 aa  941    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  73.77 
 
 		 446 aa  676    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  72.83 
 
 		 447 aa  656    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  41.78 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  44.63 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  40.27 
 
 		 498 aa  339  7e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  42.4 
 
 		 448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  41.76 
 
 		 450 aa  335  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  42.83 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  41.36 
 
 		 448 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  40.32 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  39.23 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  39.23 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  38.85 
 
 		 448 aa  309  8e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  27.03 
 
 		 625 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  26.67 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 409 aa  94  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 412 aa  92.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 400 aa  90.5  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  25.94 
 
 		 527 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  25.28 
 
 		 527 aa  90.5  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  24.15 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 407 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  25.06 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 		 523 aa  87.8  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.42 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  26.79 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  24.58 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  30.92 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  25.91 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.98 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  25 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  25.78 
 
 		 551 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  25.95 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  25.71 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  27.74 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  27.05 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  27.09 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  25.3 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  25.84 
 
 		 397 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  25.32 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  25.3 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  26.75 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  26.33 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  24.95 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  26.33 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  24.94 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  25.77 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  25.39 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  24.76 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  25.62 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  26.1 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  25.31 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  25.31 
 
 		 545 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  24.22 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  24.76 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  25.08 
 
 		 568 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  25.08 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  24.22 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  24.91 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  24.22 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  24.22 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  24.22 
 
 		 560 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  24.22 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  25.45 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  24.61 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  24.22 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  23.62 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  23.52 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.3 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  26.9 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1383  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0546545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  23.99 
 
 		 549 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  26.11 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>