147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1448 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  99.45 
 
 		 548 aa  1123    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  100 
 
 		 548 aa  1129    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  67.89 
 
 		 545 aa  742    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  99.27 
 
 		 548 aa  1122    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  64.51 
 
 		 539 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  63.81 
 
 		 540 aa  701    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  66.09 
 
 		 553 aa  730    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  67.19 
 
 		 550 aa  716    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  65.77 
 
 		 551 aa  727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  69.73 
 
 		 527 aa  781    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  66.41 
 
 		 549 aa  722    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  65.34 
 
 		 553 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  59.73 
 
 		 519 aa  661    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  66.54 
 
 		 553 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  64.73 
 
 		 560 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  68.59 
 
 		 523 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  66.54 
 
 		 553 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  99.45 
 
 		 548 aa  1123    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  65.81 
 
 		 539 aa  706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  60.89 
 
 		 565 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  99.64 
 
 		 548 aa  1125    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  68.97 
 
 		 527 aa  770    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  82.76 
 
 		 552 aa  937    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  65.9 
 
 		 561 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  68.28 
 
 		 545 aa  747    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  66.26 
 
 		 539 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  69.82 
 
 		 523 aa  766    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  68.21 
 
 		 523 aa  743    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  64.97 
 
 		 550 aa  716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  99.27 
 
 		 548 aa  1121    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  99.64 
 
 		 548 aa  1125    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  68.33 
 
 		 525 aa  768    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  65.16 
 
 		 568 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  64.35 
 
 		 526 aa  699    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  65.8 
 
 		 521 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  68.09 
 
 		 545 aa  744    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  99.45 
 
 		 548 aa  1123    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  99.64 
 
 		 548 aa  1125    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  67.7 
 
 		 545 aa  746    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  63.38 
 
 		 576 aa  695    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  64.85 
 
 		 547 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  65.15 
 
 		 547 aa  736    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  57.03 
 
 		 507 aa  630  1e-179  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1083  malate:quinone oxidoreductase  61.41 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.341711  normal  0.98769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4340  malate:quinone oxidoreductase  57.41 
 
 		 571 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1915  malate:quinone oxidoreductase  57.39 
 
 		 562 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0177221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1853  malate:quinone oxidoreductase  57.2 
 
 		 562 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  58.47 
 
 		 498 aa  589  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  55.24 
 
 		 497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  54.14 
 
 		 508 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  54.32 
 
 		 495 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  52.76 
 
 		 510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  54.88 
 
 		 501 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  52.77 
 
 		 497 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  53.86 
 
 		 492 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  53.85 
 
 		 507 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  55.18 
 
 		 500 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  53.44 
 
 		 507 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  52.67 
 
 		 493 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  51.08 
 
 		 508 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  54.36 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  53.86 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0011  malate:quinone oxidoreductase  54.04 
 
 		 492 aa  537  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  51.88 
 
 		 509 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1616  malate:quinone oxidoreductase  50.82 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  52.92 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  52.51 
 
 		 502 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  52.57 
 
 		 492 aa  528  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  52.42 
 
 		 501 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  52.41 
 
 		 502 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  52.36 
 
 		 498 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  52.51 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  54.09 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  51.6 
 
 		 503 aa  528  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  52.2 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  52.06 
 
 		 494 aa  523  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  53.05 
 
 		 500 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  53.05 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  52.85 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  52.85 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  52.85 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  52.85 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  52.85 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  52.85 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  50.5 
 
 		 517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  53.05 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  52.01 
 
 		 510 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  53.25 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  52.66 
 
 		 519 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  53.68 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  52 
 
 		 518 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  53.7 
 
 		 493 aa  508  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  51.43 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  51.84 
 
 		 488 aa  505  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  51.4 
 
 		 518 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  50.74 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  50.74 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  50.82 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  50.82 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>