142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3093 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  65.64 
 
 		 548 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  65.9 
 
 		 548 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  62.82 
 
 		 545 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  63.26 
 
 		 527 aa  712    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  62.77 
 
 		 540 aa  669    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  64.27 
 
 		 553 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  60.97 
 
 		 551 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  62.65 
 
 		 549 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  61.44 
 
 		 553 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  65.64 
 
 		 548 aa  713    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  66.92 
 
 		 523 aa  748    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  60.87 
 
 		 553 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  61.3 
 
 		 560 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  77.2 
 
 		 523 aa  843    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  60.87 
 
 		 553 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  71.43 
 
 		 539 aa  794    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  63 
 
 		 527 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  63.81 
 
 		 552 aa  693    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  100 
 
 		 561 aa  1167    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  62.82 
 
 		 545 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  77.01 
 
 		 523 aa  840    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  65.64 
 
 		 548 aa  713    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  65.64 
 
 		 548 aa  713    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  60.84 
 
 		 550 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  67.5 
 
 		 525 aa  768    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  62.11 
 
 		 568 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  72 
 
 		 526 aa  809    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  62.43 
 
 		 545 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  65.64 
 
 		 548 aa  713    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  65.45 
 
 		 548 aa  712    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  61.84 
 
 		 545 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  62.53 
 
 		 576 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  61.44 
 
 		 547 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  60.68 
 
 		 547 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  65.45 
 
 		 548 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  63.88 
 
 		 550 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  65.45 
 
 		 548 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  60.88 
 
 		 539 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  61.43 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1083  malate:quinone oxidoreductase  60.59 
 
 		 566 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.341711  normal  0.98769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  58.33 
 
 		 565 aa  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  60.48 
 
 		 521 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  59.06 
 
 		 497 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  59.15 
 
 		 495 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  55.94 
 
 		 507 aa  613  9.999999999999999e-175  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1915  malate:quinone oxidoreductase  57.5 
 
 		 562 aa  598  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0177221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4340  malate:quinone oxidoreductase  57.03 
 
 		 571 aa  598  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1853  malate:quinone oxidoreductase  58.25 
 
 		 562 aa  595  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  56.45 
 
 		 497 aa  591  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  58.13 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  57.23 
 
 		 508 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  55.86 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  58.95 
 
 		 498 aa  588  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  54.51 
 
 		 501 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0011  malate:quinone oxidoreductase  53.8 
 
 		 492 aa  552  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  56.58 
 
 		 499 aa  555  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  55.42 
 
 		 501 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  52.5 
 
 		 508 aa  548  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  54.69 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  54.08 
 
 		 507 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  52.64 
 
 		 517 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  51.22 
 
 		 493 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  53.55 
 
 		 509 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  53.97 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  53.67 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  51.12 
 
 		 492 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  54.62 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  53.16 
 
 		 502 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  51.84 
 
 		 498 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  52.74 
 
 		 500 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  52.73 
 
 		 519 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  54.18 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1616  malate:quinone oxidoreductase  50.51 
 
 		 494 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  53.8 
 
 		 493 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  51.63 
 
 		 497 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  53.77 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  53.97 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  53.97 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  53.77 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  53.97 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  53.56 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  53.97 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  53.77 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  52.24 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  51.71 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  51.77 
 
 		 492 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  52.56 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1698  malate/quinone oxidoreductase  52.56 
 
 		 498 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0112426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  51.71 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  51.63 
 
 		 502 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  51.12 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3250  malate/quinone oxidoreductase  50.2 
 
 		 497 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  51.72 
 
 		 518 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  53.98 
 
 		 488 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  52.43 
 
 		 518 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  51.63 
 
 		 502 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  50.4 
 
 		 503 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2132  malate/quinone oxidoreductase  50.1 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  50.31 
 
 		 492 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>