144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4438 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  97.01 
 
 		 502 aa  1005    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  81.95 
 
 		 502 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  82.57 
 
 		 502 aa  871    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  84.85 
 
 		 502 aa  887    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  70.24 
 
 		 510 aa  729    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  76.97 
 
 		 507 aa  797    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  72.67 
 
 		 498 aa  748    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  97.21 
 
 		 502 aa  1007    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  76.97 
 
 		 507 aa  798    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  97.01 
 
 		 502 aa  1003    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  100 
 
 		 501 aa  1034    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  60.44 
 
 		 508 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  57.03 
 
 		 508 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  55.24 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  56.71 
 
 		 501 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  57.46 
 
 		 498 aa  578  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  55.62 
 
 		 497 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  55.87 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  55.28 
 
 		 500 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  55.6 
 
 		 517 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  56.56 
 
 		 492 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  52.47 
 
 		 497 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0011  malate:quinone oxidoreductase  54.1 
 
 		 492 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  53.88 
 
 		 539 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  52.67 
 
 		 493 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  56.38 
 
 		 493 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  54.73 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1616  malate:quinone oxidoreductase  54.41 
 
 		 494 aa  541  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  57.54 
 
 		 499 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  54.19 
 
 		 523 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  53.96 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  53.66 
 
 		 526 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3250  malate/quinone oxidoreductase  54.53 
 
 		 497 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  53.99 
 
 		 523 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  52.92 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  52.92 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  52.92 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  54.64 
 
 		 519 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  52.92 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  52.92 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  52.92 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  52.92 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  52.72 
 
 		 548 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  52.72 
 
 		 548 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  53.17 
 
 		 500 aa  527  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  50.71 
 
 		 492 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  53.09 
 
 		 501 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1698  malate/quinone oxidoreductase  52.85 
 
 		 498 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0112426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  51.41 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  52.3 
 
 		 525 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  54.74 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  51.33 
 
 		 497 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  53.16 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  51.71 
 
 		 561 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  51.45 
 
 		 492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  51.45 
 
 		 492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  52.95 
 
 		 500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  53.56 
 
 		 500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  51.91 
 
 		 527 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  52.75 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  52.75 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  52.75 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  52.75 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  52.75 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  52.75 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  52.12 
 
 		 523 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  52.95 
 
 		 500 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1908  malate/quinone oxidoreductase  54.6 
 
 		 495 aa  511  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.266658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  53.75 
 
 		 552 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  52.04 
 
 		 527 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  52.13 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  53.53 
 
 		 510 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2132  malate/quinone oxidoreductase  50 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  49.29 
 
 		 499 aa  501  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  50.41 
 
 		 518 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  52.03 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  48.88 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  52.74 
 
 		 549 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1083  malate:quinone oxidoreductase  50.1 
 
 		 566 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.341711  normal  0.98769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  50.6 
 
 		 553 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  49.69 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  50.6 
 
 		 560 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  50.6 
 
 		 553 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  49.69 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0816  malate:quinone oxidoreductase  52.62 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720849  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  49.69 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  52.03 
 
 		 539 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1915  malate:quinone oxidoreductase  49.8 
 
 		 562 aa  498  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0177221  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  50.8 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  50.6 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1753  malate:quinone oxidoreductase  50.51 
 
 		 500 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  50.6 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0797  malate:quinone oxidoreductase  52.44 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.64083  normal  0.0315045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04721  malate:quinone oxidoreductase  50.72 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2629  malate:quinone oxidoreductase  50 
 
 		 498 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.765647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2683  malate:quinone oxidoreductase  50 
 
 		 498 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  51.03 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  51.31 
 
 		 521 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1853  malate:quinone oxidoreductase  49.59 
 
 		 562 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4340  malate:quinone oxidoreductase  51.31 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>