213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2603 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 463 aa  958    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  55.66 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  50.34 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  48.86 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  46.5 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  45.7 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  44.84 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  45.07 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  47.14 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  44.8 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  46.28 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  44.59 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  44.42 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  41.91 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  41.22 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  24.28 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  24.28 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  24.34 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  25.33 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  23.41 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  23.92 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  24.72 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  24.63 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  22.42 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  22.42 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  22.93 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  23.87 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  22.79 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  23.26 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  24.67 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  26.04 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20971  malate:quinone oxidoreductase  23.09 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  24.21 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  25.97 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04391  malate:quinone oxidoreductase  21.88 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1753  malate:quinone oxidoreductase  21.57 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  24.34 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  23.56 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04171  malate:quinone oxidoreductase  22.68 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04701  malate:quinone oxidoreductase  21.88 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.621872  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04721  malate:quinone oxidoreductase  21.8 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  22.32 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04801  malate:quinone oxidoreductase  21.21 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  24.83 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  25.7 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  23.84 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  23.95 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1383  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0546545  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  24.01 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  22.38 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  22.73 
 
 		 495 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  23.06 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  25.25 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  23.84 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  24.47 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  22.99 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  21.66 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  24.83 
 
 		 519 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  24.38 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  22.73 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  23.39 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0415  malate:quinone oxidoreductase  21.68 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0309175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  22.06 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  24.3 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.6 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  24.08 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  27.04 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  24.32 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  24.01 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  24.32 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  20.83 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0816  malate:quinone oxidoreductase  27.39 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720849  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  25.09 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  21.41 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  22.05 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  23.7 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  23.86 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  24.32 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  24.32 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  23.86 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  23.86 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  23.86 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1908  malate/quinone oxidoreductase  24.55 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.266658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  23.86 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  23.86 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>