215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1243 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  75.62 
 
 
448 aa  714    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  100 
 
 
451 aa  925    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  58.71 
 
 
448 aa  560  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  58.26 
 
 
450 aa  557  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  58.48 
 
 
446 aa  551  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  56.47 
 
 
448 aa  528  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  56.7 
 
 
448 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  56.47 
 
 
448 aa  523  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  57.37 
 
 
498 aa  520  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  56.47 
 
 
448 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  53.35 
 
 
446 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  47.14 
 
 
463 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  47.22 
 
 
455 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 
447 aa  332  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 
462 aa  329  6e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  41.03 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  42.83 
 
 
470 aa  316  6e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  26.82 
 
 
492 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  26.64 
 
 
527 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
527 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  24.78 
 
 
519 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 
553 aa  86.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 
493 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  24.36 
 
 
576 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2400  malate/quinone oxidoreductase  26.41 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  23.58 
 
 
521 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  23.58 
 
 
539 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  24.12 
 
 
549 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 
523 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  24.79 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  25.67 
 
 
547 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.390513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  24.72 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  25.67 
 
 
560 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  23.36 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  24.57 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  24.79 
 
 
552 aa  80.1  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  24.42 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  24.72 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  24.72 
 
 
502 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
548 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  24.44 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  24.35 
 
 
625 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  25.89 
 
 
525 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  24.66 
 
 
553 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  25.93 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  27.61 
 
 
547 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 
540 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  24.52 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  27.61 
 
 
553 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  24.73 
 
 
523 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  27.61 
 
 
553 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  25.76 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 
510 aa  77  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  24.67 
 
 
507 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20971  malate:quinone oxidoreductase  23.33 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  26.68 
 
 
498 aa  77  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  23.73 
 
 
561 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  24.34 
 
 
545 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.81 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  24.83 
 
 
507 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  24.12 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  24.34 
 
 
501 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04721  malate:quinone oxidoreductase  23.53 
 
 
508 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  24.34 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  24.45 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  24.45 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.48 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  24.94 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  24.34 
 
 
545 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  24.79 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1753  malate:quinone oxidoreductase  22.76 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  24.5 
 
 
502 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  24.67 
 
 
519 aa  73.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04391  malate:quinone oxidoreductase  23.04 
 
 
498 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  23.89 
 
 
545 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12867  malate:quinone oxidoreductase  26.1 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000016519  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  25.17 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  24.69 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1698  malate/quinone oxidoreductase  25.63 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0112426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  22.59 
 
 
568 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  23.99 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  24.15 
 
 
509 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 
503 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 
516 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 
516 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 
516 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  23.44 
 
 
494 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>