210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0434 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  100 
 
 
448 aa  916    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  75.62 
 
 
451 aa  714    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  60.4 
 
 
450 aa  568  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  58.97 
 
 
448 aa  567  1e-160  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  58.74 
 
 
446 aa  560  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  56.95 
 
 
498 aa  530  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  57.24 
 
 
448 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  56.79 
 
 
448 aa  528  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  56.79 
 
 
448 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  56.79 
 
 
448 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  53.5 
 
 
446 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  45.09 
 
 
455 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 
463 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
447 aa  342  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  40.22 
 
 
462 aa  330  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  39.86 
 
 
446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 
470 aa  317  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  25.89 
 
 
500 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  25.45 
 
 
519 aa  90.5  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  25.76 
 
 
509 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  24.45 
 
 
492 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  23.61 
 
 
625 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  25.48 
 
 
547 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  25.48 
 
 
560 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  25.58 
 
 
525 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  22.27 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2400  malate/quinone oxidoreductase  23.84 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  23.8 
 
 
508 aa  77  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  24.09 
 
 
552 aa  77  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  24.95 
 
 
500 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  25.39 
 
 
500 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  24.61 
 
 
540 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 
409 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  22.75 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  25.05 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  25.05 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  24.95 
 
 
500 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  25.59 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  24.84 
 
 
547 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  24.74 
 
 
527 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  24.35 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  24.84 
 
 
510 aa  73.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  24.37 
 
 
499 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  23.21 
 
 
551 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  25.17 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  25.17 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  25.17 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  24.67 
 
 
553 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  25.17 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  25.17 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  23.33 
 
 
521 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04171  malate:quinone oxidoreductase  22.77 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129432  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  23.79 
 
 
561 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  23.73 
 
 
510 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  24.94 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  24.04 
 
 
527 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  24.94 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  23.77 
 
 
550 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  23.77 
 
 
568 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  23.03 
 
 
548 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  24.19 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  24.11 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  24.3 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  23.79 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  22.81 
 
 
548 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  22.81 
 
 
548 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  22.81 
 
 
548 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  24.11 
 
 
545 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1698  malate/quinone oxidoreductase  24.52 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0112426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  22.81 
 
 
548 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.629978 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  22.81 
 
 
548 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  23.08 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  22.81 
 
 
548 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  22.81 
 
 
548 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  24.11 
 
 
545 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20971  malate:quinone oxidoreductase  22.72 
 
 
496 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  22.81 
 
 
548 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  24.11 
 
 
545 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  24.07 
 
 
523 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04721  malate:quinone oxidoreductase  20.9 
 
 
508 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  24.12 
 
 
518 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  23.08 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  23.58 
 
 
519 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  25.22 
 
 
516 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  24.12 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  25.22 
 
 
516 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  23.82 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  25.22 
 
 
516 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  23.83 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  23.67 
 
 
549 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  23.85 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  23.45 
 
 
550 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  24.62 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  23.26 
 
 
565 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>