139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2168 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  100 
 
 		 499 aa  1036    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  83.67 
 
 		 498 aa  880    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  66.67 
 
 		 494 aa  714    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2629  malate:quinone oxidoreductase  86.32 
 
 		 498 aa  902    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.765647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2683  malate:quinone oxidoreductase  86.32 
 
 		 498 aa  902    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  59.03 
 
 		 509 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  58.16 
 
 		 500 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  57.49 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  57.14 
 
 		 500 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  56.94 
 
 		 500 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  56.94 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  56.94 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  56.94 
 
 		 500 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  56.94 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  56.94 
 
 		 500 aa  588  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  57.14 
 
 		 500 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  56.94 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  56.53 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  53.39 
 
 		 492 aa  559  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  53.18 
 
 		 519 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 492 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 492 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  51.55 
 
 		 498 aa  525  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  50 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  50.81 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  49.8 
 
 		 501 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  51.63 
 
 		 497 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  49.59 
 
 		 510 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  49.39 
 
 		 500 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  47.66 
 
 		 517 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  49.19 
 
 		 502 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  48.87 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  49.19 
 
 		 502 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  48.19 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  49.49 
 
 		 502 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  49.29 
 
 		 501 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  48.19 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  47.98 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  48.07 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  48.68 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  47.84 
 
 		 497 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  48.37 
 
 		 493 aa  492  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  47.87 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  48.36 
 
 		 523 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  48.57 
 
 		 523 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  47.34 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  46.76 
 
 		 508 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  46.22 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  48.67 
 
 		 561 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3250  malate/quinone oxidoreductase  46.14 
 
 		 497 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  47.86 
 
 		 492 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  48.56 
 
 		 508 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  47.11 
 
 		 510 aa  480  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  46.34 
 
 		 525 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  45.93 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  45.73 
 
 		 548 aa  475  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  46.23 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 548 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  45.73 
 
 		 548 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  45.95 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  46.86 
 
 		 539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  45.8 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  45.75 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  45.64 
 
 		 540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0011  malate:quinone oxidoreductase  45.55 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  46.14 
 
 		 527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  45.95 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  46.25 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  45.95 
 
 		 547 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  48.6 
 
 		 499 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  45.55 
 
 		 553 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  45.59 
 
 		 560 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  45.55 
 
 		 553 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  46.42 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  44.72 
 
 		 565 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1616  malate:quinone oxidoreductase  45.19 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  45.55 
 
 		 545 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  46.86 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  46.63 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  45.82 
 
 		 545 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  45.44 
 
 		 545 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  45.38 
 
 		 576 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  45.59 
 
 		 547 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 527 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  45.44 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  44.92 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  43.5 
 
 		 518 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  45.02 
 
 		 552 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1915  malate:quinone oxidoreductase  45.31 
 
 		 562 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0177221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1853  malate:quinone oxidoreductase  45.31 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  45.73 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2132  malate/quinone oxidoreductase  45.59 
 
 		 508 aa  465  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  43.9 
 
 		 518 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  44.94 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  45.59 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>