143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2412 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  66.67 
 
 		 499 aa  714    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  67.95 
 
 		 498 aa  732    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  100 
 
 		 494 aa  1030    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2629  malate:quinone oxidoreductase  66.6 
 
 		 498 aa  713    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.765647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2683  malate:quinone oxidoreductase  66.6 
 
 		 498 aa  713    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  53.8 
 
 		 500 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  53.5 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  53.7 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  53.04 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  53.44 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  52.83 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  49.29 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  49.29 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  49.8 
 
 		 519 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  49.28 
 
 		 492 aa  511  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  48.99 
 
 		 495 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  48.87 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  49.28 
 
 		 497 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  46.64 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  47.87 
 
 		 508 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  46.95 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  48.06 
 
 		 510 aa  478  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  45.92 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  47.15 
 
 		 500 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  47.85 
 
 		 526 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  44.72 
 
 		 517 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  46.76 
 
 		 518 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  45.75 
 
 		 518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  48.26 
 
 		 497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  47.34 
 
 		 523 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  47.24 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  47.13 
 
 		 523 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  45.53 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  46.83 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3250  malate/quinone oxidoreductase  43.41 
 
 		 497 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  46.17 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  46.17 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  46.17 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  45.47 
 
 		 507 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  45.34 
 
 		 494 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  45.47 
 
 		 507 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  45.17 
 
 		 493 aa  458  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  45.82 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  45.92 
 
 		 493 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  45.6 
 
 		 525 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  45.27 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  45.84 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  47.07 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1698  malate/quinone oxidoreductase  45.36 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0112426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  46.25 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0011  malate:quinone oxidoreductase  45.05 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  45.51 
 
 		 498 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  45.84 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  45.84 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2132  malate/quinone oxidoreductase  44.94 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  46.09 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  45.57 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  45.16 
 
 		 510 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  45.31 
 
 		 540 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  44.74 
 
 		 523 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  44.17 
 
 		 553 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  44.17 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  44.17 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  46.09 
 
 		 539 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  44.26 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  43.43 
 
 		 545 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  44.02 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  44.13 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  44.44 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  45.27 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  44.02 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  44.79 
 
 		 527 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  44.99 
 
 		 527 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  44.88 
 
 		 561 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  43.03 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  44.02 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  44.02 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  44.53 
 
 		 521 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  44.02 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  43.97 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  44.02 
 
 		 548 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  42.63 
 
 		 545 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  42.71 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  43.15 
 
 		 560 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  44.02 
 
 		 548 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  42.71 
 
 		 545 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  44.02 
 
 		 548 aa  438  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  43.15 
 
 		 547 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  44.65 
 
 		 502 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  43.76 
 
 		 507 aa  432  1e-120  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12867  malate:quinone oxidoreductase  42.8 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000016519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  43.33 
 
 		 576 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  44.17 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>