165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6727 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6727  response regulator receiver protein  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 483 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  33.59 
 
 		 580 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  33.59 
 
 		 685 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3805  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 167 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 640 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1364  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 485 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 461 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4340  KaiB domain protein  36.26 
 
 		 115 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464711  decreased coverage  0.000276339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4192  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 454 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1011 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 816 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1362 aa  49.3  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 686 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0866  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 496 aa  48.9  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555974  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 458 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 457 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  27.15 
 
 		 1390 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 909 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0008  KaiB domain protein  36.84 
 
 		 94 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1479  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.17 
 
 		 445 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3216  type IV pilus expression regulatory protein  29.27 
 
 		 537 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 840 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3651  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 445 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 652 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0742  KaiB  35.53 
 
 		 92 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 853 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3992  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4357  circadian clock protein kaiB  34.41 
 
 		 107 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4386  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 846 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 652 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3167  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 758 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000450225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2968  KaiB domain-containing protein  35.48 
 
 		 113 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4794  response regulator receiver protein  40.51 
 
 		 462 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3903  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.77 
 
 		 455 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000574971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2543  KaiB  37.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1032 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1234 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 375 aa  45.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3983  circadian clock KaiB-like protein  37.33 
 
 		 89 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 777 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 745 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1786 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0538  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.74 
 
 		 473 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3669  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 373 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3383  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 475 aa  45.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  34.43 
 
 		 125 aa  45.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2825  transcriptional regulator ZraR  29.92 
 
 		 445 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.479389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2938  transcriptional regulator ZraR  29.92 
 
 		 445 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2763  transcriptional regulator ZraR  29.92 
 
 		 445 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1498  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 500 aa  45.1  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.42 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1960  response regulator transcription factor  31.58 
 
 		 471 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2804  transcriptional regulatory protein ZraR  29.92 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 		 124 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 551 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5171  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 749 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00341574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 689 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.52 
 
 		 502 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5688  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 749 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00115642  decreased coverage  0.000406473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04881  two-component system regulatory protein  30.43 
 
 		 466 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.476586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1549  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.637407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2826  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3630  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 502 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.670707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.71 
 
 		 446 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3049  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.5 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  28.18 
 
 		 1278 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2721  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  29.92 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2768  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.47 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 628 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4548  histidine kinase  38.05 
 
 		 749 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000713404  normal  0.70634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0380  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 522 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200588 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 855 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0010  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 764 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00266104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.89 
 
 		 445 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4294  circadian clock protein KaiB  37.33 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  33.6 
 
 		 829 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4309  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.13 
 
 		 1233 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.45 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3090  Fis family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 560 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4156  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 443 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 716 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4232  circadian clock protein KaiB  37.33 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 		 969 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.26 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01277  putative sigma-54 interacting response regulator protein  29.2 
 
 		 443 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 811 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 657 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 393 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 754 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3819  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.86 
 
 		 455 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 513 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3629  two-component system response regulator  29.6 
 
 		 445 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1259  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 445 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>