68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3983 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3983  circadian clock KaiB-like protein  100 
 
 
89 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644905  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3312  hypothetical protein  92.13 
 
 
91 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.967746  normal  0.156709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2543  KaiB  78.41 
 
 
96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0008  KaiB domain protein  72.94 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0742  KaiB  71.76 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1662  KaiB domain protein  62.79 
 
 
103 aa  114  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4590  KaiB domain protein  61.9 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463032  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6553  circadian clock protein  62.65 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2968  KaiB domain-containing protein  63.1 
 
 
113 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4477  KaiB domain protein  61.9 
 
 
130 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22265  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4109  KaiB domain-containing protein  61.9 
 
 
130 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11763  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1485  KaiB domain-containing protein  60.24 
 
 
133 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.04601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4340  KaiB domain protein  65.85 
 
 
115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464711  decreased coverage  0.000276339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4009  KaiB domain-containing protein  57.14 
 
 
97 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1362  KaiB domain protein  61.45 
 
 
100 aa  104  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3121  KaiB domain protein  59.21 
 
 
107 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.282526  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1883  KaiB domain protein  59.04 
 
 
97 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal  0.619396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4149  KaiB domain-containing protein  56.63 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0589651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3358  KaiB domain-containing protein  56.63 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5076  circadian clock protein KaiB  54.22 
 
 
103 aa  92  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0600  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4108  KaiB domain-containing protein  51.19 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125834  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4232  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4294  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15291  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
105 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05431  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15441  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.622562  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2125  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1017  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0347  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.891405  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3804  circadian clock protein KaiB  53.01 
 
 
104 aa  90.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573058  normal  0.0709765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1217  circadian clock protein KaiB  51.81 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0548  circadian clock protein KaiB  51.81 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.346159  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17701  circadian clock protein KaiB  51.81 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0105532  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1441  circadian clock protein KaiB  51.81 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0914  circadian clock protein KaiB  51.81 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1661  KaiB domain protein  48.19 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1617  KaiB domain-containing protein  46.99 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.155318  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4476  KaiB domain protein  52.56 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15041  circadian clock protein KaiB  50.6 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.293704  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13971  circadian clock protein KaiB  50.6 
 
 
114 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.16 
 
 
640 aa  87  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2969  KaiB domain-containing protein  47.62 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4357  circadian clock protein kaiB  48.81 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3005  KaiB domain protein  48.19 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4589  KaiB domain protein  48.24 
 
 
134 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4010  KaiB domain-containing protein  50 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1486  KaiB domain-containing protein  44.58 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26267  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3933  KaiB domain protein  45.78 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1882  KaiB domain protein  43.37 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.980296  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3982  KaiB domain protein  45.78 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00133948  hitchhiker  0.00598629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2227  KaiB domain-containing protein  44.71 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4339  KaiB domain protein  48.72 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42541  decreased coverage  0.000274688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1363  KaiB domain protein  45.88 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1119  hypothetical protein  43.02 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1115  hypothetical protein  43.02 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0619  KaiB domain protein  43.75 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5028  KaiB domain protein  37.18 
 
 
247 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3661  KaiB  37.18 
 
 
254 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.535512  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4671  KaiB  37.18 
 
 
254 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.131957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3294  KaiB  41.56 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3323  KaiB domain protein  33.33 
 
 
247 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2778  KaiB domain protein  33.33 
 
 
247 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0014  KaiB domain-containing protein  37.04 
 
 
251 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1544  KaiB domain protein  33.77 
 
 
238 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6727  response regulator receiver protein  37.33 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3573  response regulator receiver domain-containing protein  32.91 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0609  histidine kinase  34.72 
 
 
395 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>