180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2746 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  88.26 
 
 		 213 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  84.98 
 
 		 213 aa  377  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  83.1 
 
 		 212 aa  362  2e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  82.63 
 
 		 212 aa  359  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  68.88 
 
 		 208 aa  286  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  64.02 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  61.03 
 
 		 212 aa  279  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  64.93 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  58.94 
 
 		 209 aa  262  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  54.93 
 
 		 207 aa  247  9e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  53.27 
 
 		 212 aa  234  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  51.63 
 
 		 213 aa  231  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  29.51 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  30.7 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  30.84 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  27.51 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  29.26 
 
 		 450 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  25.68 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  28.65 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  27.36 
 
 		 447 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 303 aa  53.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  27.64 
 
 		 446 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 314 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  26.37 
 
 		 477 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  27.78 
 
 		 297 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  26 
 
 		 470 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  27.87 
 
 		 315 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  25.79 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  26.2 
 
 		 441 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  26.83 
 
 		 298 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  30.37 
 
 		 455 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  26.56 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  26.53 
 
 		 446 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  25.98 
 
 		 473 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  25.38 
 
 		 470 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  27.72 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  28.12 
 
 		 299 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  27.03 
 
 		 462 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  25.27 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  27.42 
 
 		 300 aa  48.5  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  27.8 
 
 		 483 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  25.25 
 
 		 448 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  26.29 
 
 		 297 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  26.13 
 
 		 474 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  24.87 
 
 		 441 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  26.02 
 
 		 446 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  25.87 
 
 		 460 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  25.4 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  26.02 
 
 		 446 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  27.8 
 
 		 483 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  26.29 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  26.29 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  30.29 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  28.18 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  26.96 
 
 		 456 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  27.8 
 
 		 483 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  26 
 
 		 473 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  23.44 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  28.65 
 
 		 459 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  24.61 
 
 		 296 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  27.73 
 
 		 441 aa  46.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  27.69 
 
 		 494 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  26.74 
 
 		 458 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13790  GTP-binding protein Era  28.65 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  29.9 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  27.5 
 
 		 303 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  27.37 
 
 		 449 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  35.94 
 
 		 431 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  25.13 
 
 		 474 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  27.47 
 
 		 303 aa  45.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 		 467 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.26 
 
 		 438 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  25.52 
 
 		 314 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  25.87 
 
 		 460 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  24.61 
 
 		 296 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  26.29 
 
 		 448 aa  45.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 		 301 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  25.52 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  26.64 
 
 		 463 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  25.74 
 
 		 473 aa  44.7  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  25.53 
 
 		 461 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17172  predicted protein  29.17 
 
 		 551 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.496601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  26.94 
 
 		 458 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  25.26 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  24.23 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  25.53 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  25.26 
 
 		 461 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  23.44 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  26.46 
 
 		 445 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  26.32 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  24.23 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  24.48 
 
 		 417 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  28.72 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  25.12 
 
 		 458 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  26.88 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>