199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1793 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 213 aa  436  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  79.25 
 
 		 212 aa  361  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  76.5 
 
 		 217 aa  350  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  70.73 
 
 		 209 aa  314  7e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  72.91 
 
 		 208 aa  311  5.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  64.49 
 
 		 213 aa  292  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  63.55 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  64.02 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  62.62 
 
 		 212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  63.08 
 
 		 212 aa  271  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  58.5 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  61.5 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  53.49 
 
 		 213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  28.65 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  30.53 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  28.8 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  27.83 
 
 		 446 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  26.9 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  27.04 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  28.72 
 
 		 461 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  27.89 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  26.22 
 
 		 636 aa  51.6  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  26.04 
 
 		 458 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0083  GTP-binding protein EngA  29.5 
 
 		 476 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  26.84 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  27.98 
 
 		 622 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  27.84 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  27.8 
 
 		 440 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  24.38 
 
 		 462 aa  50.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  28.85 
 
 		 470 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  25.7 
 
 		 460 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  28.14 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  26.94 
 
 		 450 aa  49.3  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  28.04 
 
 		 641 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  26.37 
 
 		 315 aa  48.9  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  25.22 
 
 		 487 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  27.81 
 
 		 620 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  28.04 
 
 		 450 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  25.25 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  27.66 
 
 		 473 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  27.72 
 
 		 454 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  30.59 
 
 		 484 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  25.93 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  27.41 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  27.66 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  26.7 
 
 		 518 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  26.87 
 
 		 294 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  26.49 
 
 		 294 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  25.77 
 
 		 630 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  28.22 
 
 		 620 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  26.63 
 
 		 645 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  27.47 
 
 		 463 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  27.32 
 
 		 445 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  24.26 
 
 		 461 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  26.73 
 
 		 473 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  26.26 
 
 		 446 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  25.24 
 
 		 444 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  25.38 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  28.95 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  27.71 
 
 		 640 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  26.26 
 
 		 446 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  26.32 
 
 		 628 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  26.88 
 
 		 633 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  24.62 
 
 		 301 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  25 
 
 		 478 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  25.59 
 
 		 459 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  26.19 
 
 		 642 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 307 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  27.83 
 
 		 459 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  26.63 
 
 		 641 aa  46.2  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  24.75 
 
 		 456 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  25.79 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  24.62 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  27.38 
 
 		 650 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  26.42 
 
 		 455 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  27.5 
 
 		 643 aa  45.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  24.62 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  24.41 
 
 		 460 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  24.62 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  25.38 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  25.49 
 
 		 447 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  29.19 
 
 		 613 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  26.92 
 
 		 601 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  26.26 
 
 		 446 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  26.9 
 
 		 301 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  25.31 
 
 		 636 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  24.87 
 
 		 303 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  25.6 
 
 		 642 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  27.85 
 
 		 617 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  28.04 
 
 		 450 aa  45.1  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  20.95 
 
 		 460 aa  45.1  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  25.77 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  26.02 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>