More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3778 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  96.23 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  84.98 
 
 		 213 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  83.57 
 
 		 213 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  82.63 
 
 		 213 aa  359  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  63.85 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  67.35 
 
 		 208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  63.08 
 
 		 213 aa  271  5.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  65.7 
 
 		 217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.9 
 
 		 209 aa  254  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  57.84 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  56.54 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  51.63 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  30.98 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  29.35 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  28.65 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  27.42 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  27.23 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  28.19 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  28.26 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  26.94 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  26.06 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  27.41 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  26.37 
 
 		 489 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  25.91 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  29.19 
 
 		 494 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  26.84 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  26.73 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  28.34 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  31.74 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  29.02 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  27.18 
 
 		 492 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  28.21 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  24.51 
 
 		 490 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  28.71 
 
 		 458 aa  52.4  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  30.16 
 
 		 301 aa  52.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  29.19 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  26.42 
 
 		 320 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  27.32 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  26.7 
 
 		 300 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  25.65 
 
 		 297 aa  52  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  27 
 
 		 454 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 314 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  25.85 
 
 		 473 aa  51.2  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  25.26 
 
 		 455 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  28.02 
 
 		 463 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  27.46 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  25.7 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  23.67 
 
 		 479 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  26.8 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  29.47 
 
 		 449 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  26.06 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  27.42 
 
 		 493 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  28.88 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  26.34 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  27.72 
 
 		 470 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  32.26 
 
 		 303 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  28.11 
 
 		 303 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  28.11 
 
 		 303 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  28.11 
 
 		 303 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  24.87 
 
 		 301 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  28.8 
 
 		 456 aa  48.9  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  27.62 
 
 		 303 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  31.58 
 
 		 312 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 460 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  25.79 
 
 		 324 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  25.53 
 
 		 295 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  29.41 
 
 		 303 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  25.39 
 
 		 301 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  25.93 
 
 		 293 aa  48.5  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  26.7 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  26.7 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  24.87 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  28.04 
 
 		 459 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  23.9 
 
 		 477 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.42 
 
 		 438 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  23.5 
 
 		 459 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  24.87 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  27.57 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  28.65 
 
 		 602 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  26.6 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.5 
 
 		 493 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  26.88 
 
 		 473 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  25.53 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  29.02 
 
 		 334 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  27.87 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  23.15 
 
 		 473 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  27.32 
 
 		 487 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  24.61 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  26.98 
 
 		 330 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  25.93 
 
 		 461 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  28.87 
 
 		 446 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  27.75 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  25.5 
 
 		 456 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  26.42 
 
 		 294 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  24.47 
 
 		 483 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  26.7 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  24.87 
 
 		 344 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  25.95 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>