203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2664 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  83.09 
 
 
217 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  79.25 
 
 
213 aa  361  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  75.24 
 
 
208 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  70.59 
 
 
209 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  63.85 
 
 
213 aa  287  8e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  62.44 
 
 
213 aa  286  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  63.38 
 
 
212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  63.85 
 
 
212 aa  281  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  61.03 
 
 
213 aa  279  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  61.97 
 
 
212 aa  271  6e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  60.4 
 
 
207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  52.8 
 
 
213 aa  241  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  31.58 
 
 
299 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  26.04 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  30.69 
 
 
462 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  25.38 
 
 
303 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  26.6 
 
 
302 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  26.88 
 
 
297 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  25.52 
 
 
302 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  29.17 
 
 
461 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  27.18 
 
 
297 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  29.23 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  27.46 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 
303 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  27.75 
 
 
446 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  27.89 
 
 
298 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  27.1 
 
 
459 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 
296 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  28.27 
 
 
438 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  26.6 
 
 
458 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  26.06 
 
 
294 aa  48.9  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  27.72 
 
 
463 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  28.8 
 
 
454 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  26.46 
 
 
473 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  25 
 
 
462 aa  48.1  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  28.85 
 
 
605 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0047  GTP-binding protein, HSR1-related  25.75 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  26.18 
 
 
301 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2195  GTP-binding protein LepA  25.91 
 
 
596 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0205071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  29.95 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  27.84 
 
 
489 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  24.62 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  26.46 
 
 
300 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  26.63 
 
 
311 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  26.46 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  25.91 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 
300 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  27.18 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  25.63 
 
 
461 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  26.84 
 
 
518 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  25.77 
 
 
461 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  25 
 
 
460 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  26.19 
 
 
622 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  28.65 
 
 
294 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  25.48 
 
 
608 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  27.6 
 
 
294 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  26.78 
 
 
298 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 
884 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  26.53 
 
 
314 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  26.11 
 
 
455 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  26.77 
 
 
456 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  27.13 
 
 
303 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  23.44 
 
 
433 aa  45.8  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  28.35 
 
 
444 aa  45.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  25.85 
 
 
445 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  26.6 
 
 
450 aa  45.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  26.63 
 
 
487 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  27.84 
 
 
337 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  25.91 
 
 
314 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  28.92 
 
 
881 aa  45.1  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  25.91 
 
 
314 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 
300 aa  45.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  24.49 
 
 
299 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 
446 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  23.61 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  26.32 
 
 
455 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4597  GTP-binding protein EngA  27.13 
 
 
490 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  25.58 
 
 
636 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 
446 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  28.29 
 
 
324 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  26.74 
 
 
313 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 
896 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  27.95 
 
 
610 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  26.44 
 
 
456 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 
885 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  25.6 
 
 
641 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  28.86 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0118  GTP-binding protein LepA  24.48 
 
 
625 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702827  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 
882 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  26.7 
 
 
601 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  30.12 
 
 
896 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  23.61 
 
 
311 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  28.48 
 
 
311 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  26.54 
 
 
457 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  31.17 
 
 
488 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  31.17 
 
 
488 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  24.75 
 
 
446 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  24.68 
 
 
630 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>