268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1929 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  100 
 
 
212 aa  430  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  96.23 
 
 
212 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  85.92 
 
 
213 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  83.1 
 
 
213 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  83.1 
 
 
213 aa  362  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  63.38 
 
 
212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  62.62 
 
 
213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  65.22 
 
 
217 aa  271  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  65.31 
 
 
208 aa  268  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.87 
 
 
209 aa  259  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  56.86 
 
 
207 aa  244  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  56.07 
 
 
212 aa  241  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  51.16 
 
 
213 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  30.43 
 
 
299 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  28.26 
 
 
298 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  31.09 
 
 
299 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 
303 aa  56.6  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  29.19 
 
 
297 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  28.11 
 
 
494 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  28.19 
 
 
302 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  27.23 
 
 
314 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  26.46 
 
 
297 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  26.37 
 
 
489 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  25.26 
 
 
455 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  27 
 
 
454 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  26.73 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  24.51 
 
 
490 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  27.23 
 
 
321 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 
463 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  26.77 
 
 
320 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  28.71 
 
 
458 aa  52.4  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  27.81 
 
 
315 aa  52.4  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  26.84 
 
 
302 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  26.63 
 
 
492 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  26.6 
 
 
324 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  26.34 
 
 
493 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 
296 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  25.53 
 
 
294 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 
301 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  29.19 
 
 
302 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  30.54 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  29.95 
 
 
303 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  23.9 
 
 
477 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  23.9 
 
 
479 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  27 
 
 
314 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  26.42 
 
 
302 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  27.6 
 
 
473 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  25.37 
 
 
473 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  25.14 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  26.18 
 
 
300 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  25.76 
 
 
320 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  26.32 
 
 
324 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  27.18 
 
 
300 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  27.89 
 
 
449 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  26.34 
 
 
300 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.34 
 
 
438 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  26.91 
 
 
460 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  26.06 
 
 
303 aa  48.5  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  27.51 
 
 
506 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  26.46 
 
 
293 aa  48.5  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  27.51 
 
 
483 aa  48.5  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  29.23 
 
 
446 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  27.07 
 
 
303 aa  48.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  26.88 
 
 
473 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.5 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  26.34 
 
 
470 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  27.81 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  26.94 
 
 
416 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  28.11 
 
 
303 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  25.86 
 
 
630 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  24.08 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  25.77 
 
 
303 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  32.26 
 
 
303 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  29.41 
 
 
450 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  27.51 
 
 
459 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  25.39 
 
 
296 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  28.11 
 
 
303 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  26.98 
 
 
329 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  26 
 
 
456 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  25.82 
 
 
487 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  28.11 
 
 
303 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  26.98 
 
 
483 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  26.18 
 
 
311 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  26.18 
 
 
311 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  25.26 
 
 
461 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  25.71 
 
 
633 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  23.76 
 
 
474 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  25.39 
 
 
296 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  28.26 
 
 
456 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  24.87 
 
 
301 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  26.9 
 
 
501 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  26.98 
 
 
330 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  24.47 
 
 
483 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  29.32 
 
 
458 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  24.62 
 
 
1104 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  26.26 
 
 
309 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  25.59 
 
 
459 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  29.79 
 
 
312 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  27.57 
 
 
309 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 
300 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>