137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2232 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  83.09 
 
 		 212 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  76.5 
 
 		 213 aa  350  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  76.21 
 
 		 208 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  70.73 
 
 		 209 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  69.9 
 
 		 213 aa  287  7e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  68.88 
 
 		 213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  64.93 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  65.22 
 
 		 212 aa  271  6e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  65.7 
 
 		 212 aa  268  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  60.59 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  60.78 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  55.77 
 
 		 213 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  31.55 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  30.43 
 
 		 462 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  27.72 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0680  GTP-binding protein Era  23.96 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  27.46 
 
 		 450 aa  51.6  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  28.04 
 
 		 302 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  28.72 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  24.63 
 
 		 460 aa  50.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  26.74 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  26.94 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  26.98 
 
 		 302 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  23.19 
 
 		 462 aa  48.9  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 		 295 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  28.19 
 
 		 461 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  24.48 
 
 		 296 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  27.13 
 
 		 297 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  24.48 
 
 		 296 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  24.61 
 
 		 303 aa  48.5  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0083  GTP-binding protein EngA  27.78 
 
 		 476 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  26 
 
 		 444 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  27.03 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 435 aa  47  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  28.04 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  27.31 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  26.78 
 
 		 463 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  23.68 
 
 		 294 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  31.07 
 
 		 636 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  25.91 
 
 		 299 aa  45.8  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  28.26 
 
 		 303 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  26.8 
 
 		 324 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  27.55 
 
 		 307 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  27.69 
 
 		 311 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  27.81 
 
 		 298 aa  45.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  25.4 
 
 		 478 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  26.88 
 
 		 303 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  27.03 
 
 		 487 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  25.68 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  29.17 
 
 		 300 aa  45.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  26.74 
 
 		 297 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  27.75 
 
 		 531 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  28.71 
 
 		 642 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  26.94 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  25.24 
 
 		 463 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  23.68 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  27.96 
 
 		 454 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  28.04 
 
 		 516 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  23.44 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  26.6 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  25.6 
 
 		 456 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  26.54 
 
 		 622 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  27.75 
 
 		 489 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  24.6 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  31.31 
 
 		 438 aa  44.3  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  27.08 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  24.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  24.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  24.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  27.87 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  27.27 
 
 		 662 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  27.89 
 
 		 441 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  25.93 
 
 		 641 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  29.57 
 
 		 516 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  25.5 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  24.19 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  23.27 
 
 		 461 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  26.84 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  25 
 
 		 458 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  23.56 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  26.04 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  24.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  24.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  27.42 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4597  GTP-binding protein EngA  27.13 
 
 		 490 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  25.59 
 
 		 457 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  24.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  27.42 
 
 		 438 aa  43.5  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  29.52 
 
 		 633 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  28.72 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  28.21 
 
 		 605 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  28.72 
 
 		 303 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  26.79 
 
 		 455 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  26.09 
 
 		 489 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  26.34 
 
 		 446 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  28.65 
 
 		 446 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  26.06 
 
 		 461 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  26.34 
 
 		 446 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>