280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1615 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0814  GTP-binding protein HSR1-related  89.67 
 
 		 213 aa  401  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2746  GTP-binding protein HSR1-related  84.98 
 
 		 213 aa  377  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1929  small GTP-binding protein  85.92 
 
 		 212 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3778  small GTP-binding protein  84.98 
 
 		 212 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2664  small GTP-binding protein  63.85 
 
 		 212 aa  287  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000173682  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1793  GTP-binding protein, HSR1-related  63.55 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0804701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2232  GTP-binding protein, HSR1-related  68.88 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0751  hypothetical protein  69.23 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2908  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.9 
 
 		 209 aa  266  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1219  small GTP-binding protein  56.07 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1892  small GTP-binding protein  54.93 
 
 		 207 aa  245  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  49.3 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  30.85 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  28.95 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  28.19 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  29.79 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  26.56 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  25.4 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  29.26 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  26.73 
 
 		 489 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  29.47 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  28.12 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  28.8 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  29.57 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  28.95 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0680  GTP-binding protein Era  26.7 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  28.65 
 
 		 314 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  26.04 
 
 		 303 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  27.23 
 
 		 490 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  27.4 
 
 		 492 aa  52  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  26.53 
 
 		 446 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  27.32 
 
 		 300 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  26.4 
 
 		 308 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  24.48 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.1 
 
 		 438 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  24.54 
 
 		 314 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  25.25 
 
 		 448 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  30.11 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  26.29 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.02 
 
 		 493 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  27.51 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  28.11 
 
 		 456 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  28.02 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 301 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  26.56 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  29.35 
 
 		 309 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  25.85 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  24.12 
 
 		 447 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  29.57 
 
 		 302 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  26.32 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  24 
 
 		 344 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  27.6 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  26.53 
 
 		 446 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  26.53 
 
 		 446 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  25.67 
 
 		 441 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  25.25 
 
 		 446 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  25.76 
 
 		 473 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  25.49 
 
 		 473 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  27.17 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13790  GTP-binding protein Era  28.36 
 
 		 300 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  24.35 
 
 		 296 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 		 299 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  23.74 
 
 		 344 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  27.89 
 
 		 311 aa  48.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  29.17 
 
 		 450 aa  48.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  26.29 
 
 		 329 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  24.34 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  28.11 
 
 		 458 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  24.74 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  28.72 
 
 		 443 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  26.84 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  26.94 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  24.76 
 
 		 477 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  24.35 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  27.73 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  26.18 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  23.12 
 
 		 337 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  23.96 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  24.54 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  26.6 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  25.79 
 
 		 449 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.02 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  26.84 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  28.11 
 
 		 461 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  24.87 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  26.87 
 
 		 456 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  23.12 
 
 		 337 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  27.17 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>