59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1645 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  624  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  52.02 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  37.11 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  38.33 
 
 		 203 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  38.25 
 
 		 227 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 		 228 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  42.14 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  39.26 
 
 		 275 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  36.59 
 
 		 222 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  40.41 
 
 		 229 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  39.62 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  35.91 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  32.07 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  37.72 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  33.52 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  37.09 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  31.31 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  32.38 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  33.55 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  35.52 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  34.44 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  34.29 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  36.3 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  34.3 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  37.24 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  34.57 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  31.84 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  32.38 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  58.49 
 
 		 1984 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  31.07 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  31.25 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  28.93 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  31.52 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  27.42 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  31.22 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  33.17 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  30.7 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  37.14 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  33.09 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  30.06 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  30.57 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  25.81 
 
 		 203 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  27.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  34.18 
 
 		 1112 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  31.75 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  29.49 
 
 		 201 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  28.85 
 
 		 206 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  34 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  28.64 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  32.2 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  30.13 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.91 
 
 		 1328 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  31.16 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  25.79 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  28.14 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>