42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1666 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  47.74 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  36.82 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  34.93 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  34.72 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  31.51 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  33.14 
 
 		 320 aa  85.1  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  30.12 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  34.76 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  33.15 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  33.12 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  35.97 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  32.47 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  36.8 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  35 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  29.61 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  30.05 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  34.81 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  29.35 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  35.04 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  30.61 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  29.51 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  26.55 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  28.75 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  31.47 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  26.03 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  29.1 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  31.82 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  28.36 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  26.7 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  26.97 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  31.58 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  29.2 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  28.99 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  27.56 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  27.46 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  32.43 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  28.98 
 
 		 312 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  28.48 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>