47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04980 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  35.56 
 
 
271 aa  89  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  32.8 
 
 
234 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  33.52 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  33.82 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  35.32 
 
 
229 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  33.75 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  29.57 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  30.16 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  29.61 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  35.12 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  33.53 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07640  stress response protein Rds1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12490)  26.59 
 
 
486 aa  66.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.413298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  33.33 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  30.07 
 
 
240 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  33.33 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  32.28 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  34.08 
 
 
275 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  33.96 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05292  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 
458 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  30.34 
 
 
239 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  32.88 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  28.42 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  32.52 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  30.57 
 
 
241 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  29.32 
 
 
222 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  29.3 
 
 
239 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  30.12 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  29.05 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  35.04 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  31.13 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  27.46 
 
 
248 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  30.72 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  28.24 
 
 
251 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  30.07 
 
 
209 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00050  Rds1 protein, putative  26.21 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  28.65 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  29.26 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  29.52 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  24.34 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  27.71 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  27.71 
 
 
325 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  31.25 
 
 
221 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>