44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0162 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  51.39 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  55.56 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  49.32 
 
 		 290 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  54.31 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  49.5 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  47.34 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  46.73 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  46.41 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  37.74 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  32.51 
 
 		 240 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  36.76 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  34.39 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  34.58 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  34.25 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  34.46 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  32.37 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  35.98 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  36.21 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  30.66 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  31.1 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  33.8 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  34.09 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  34.66 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  31.98 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  35.11 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  29.52 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  35.16 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  32.96 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  31.7 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  28.38 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  27.73 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  30.98 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  29.74 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  29.37 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  24.37 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  30.46 
 
 		 218 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  28.85 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  29.52 
 
 		 209 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>