43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3240 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  72.8 
 
 		 237 aa  350  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  57.49 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  56.6 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  54.46 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  49.17 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  45.53 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  41.94 
 
 		 239 aa  178  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  48.25 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  35.1 
 
 		 216 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  37.04 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  40.31 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  40.6 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  43.65 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  34.64 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  38.69 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  36.81 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  29.46 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  38.93 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  43.61 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  34.51 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  30.87 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  29.91 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  36.17 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  38.93 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  32 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  37.24 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  31.53 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  34.53 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  29.28 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  42.06 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  32.35 
 
 		 311 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  28 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  31.75 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  29.79 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  25.78 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  30.73 
 
 		 325 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>