57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3503 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
228 aa  455  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  42.68 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  37.79 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  41.62 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  41.41 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  38.06 
 
 
223 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  39.18 
 
 
234 aa  104  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  41.04 
 
 
247 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  40 
 
 
320 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  38.89 
 
 
262 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  34.67 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  33.65 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  44.62 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  38.97 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  41.91 
 
 
278 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  33.81 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  37.75 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  29.67 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  34.18 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  37.32 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  40.31 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  32 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  32.57 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  35.98 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  30.43 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  38.41 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  30.43 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  30.56 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  33.86 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  29.35 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  29.61 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  29.78 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  29.71 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  31.61 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  31.84 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  32.69 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  32.43 
 
 
284 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  32.69 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  30.17 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  29.19 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  29.5 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  26.39 
 
 
310 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  26.63 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  31.85 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  30.23 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  30.23 
 
 
326 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  30.86 
 
 
325 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  28.07 
 
 
307 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  29.65 
 
 
323 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 
296 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  29.93 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604576 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05292  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 
458 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  30 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>