31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3389 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  89.47 
 
 		 190 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  77.37 
 
 		 189 aa  276  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  71.35 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  60.64 
 
 		 201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  59.49 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  62.5 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  57.75 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  67.92 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  67.3 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  55.98 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  34.87 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  37.8 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  29.78 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  36.26 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  31.49 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  31.33 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  32.95 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  29.65 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  32.68 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  29.53 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  27.72 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  31.08 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1848  hypothetical protein  27.04 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  34.44 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  30.06 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  31.82 
 
 		 247 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  32.97 
 
 		 312 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>