32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2962 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  95.92 
 
 		 221 aa  315  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  62.56 
 
 		 190 aa  224  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  64.71 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  68.04 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  65.38 
 
 		 190 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  57.3 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  54.12 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  55.43 
 
 		 206 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  55.74 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  55.74 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  36.88 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  36.57 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  32.78 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  36.9 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  29.66 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  33.79 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  29.87 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  32.12 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  29.03 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1848  hypothetical protein  28.3 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  31.34 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  29.66 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  38.3 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  28.68 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  27.86 
 
 		 185 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  36.59 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  27.07 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  28.26 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>