26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2170 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  90.05 
 
 		 201 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  84.65 
 
 		 203 aa  351  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  77.6 
 
 		 204 aa  298  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  72.13 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  60.64 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  59.12 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  56.91 
 
 		 190 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  59.56 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  53.73 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  60.13 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  35.48 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  32.95 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  32.87 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  32.14 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  30.2 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  31.45 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  28.95 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  31.28 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  30.43 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  28.98 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  28.1 
 
 		 320 aa  45.1  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>