34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2125 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  71.35 
 
 		 190 aa  256  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  68.39 
 
 		 190 aa  248  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  72.88 
 
 		 189 aa  245  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  61.67 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  58.82 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  60.44 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  58.56 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  59.12 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  64.78 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  64.78 
 
 		 196 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  33.55 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  37.7 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  36.2 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  32.56 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  35.06 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  32.24 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  31.43 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1848  hypothetical protein  27.67 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  35.82 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  28.86 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  30.38 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  28.79 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  27.59 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  29.63 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  26.85 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  28.19 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  27.86 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  28.38 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  28.15 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  28.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>