30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2360 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  87.62 
 
 		 201 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  84.65 
 
 		 201 aa  351  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  78.16 
 
 		 204 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  77.6 
 
 		 206 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  62.5 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  60.44 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  60.22 
 
 		 190 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  60 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  59.87 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  59.24 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  36.99 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  35.03 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  36.87 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  29.35 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  32.87 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  34.59 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  34.59 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  27.78 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  30.87 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  32.9 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  29.21 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  28.76 
 
 		 320 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  30.87 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  29.47 
 
 		 247 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1848  hypothetical protein  25.95 
 
 		 168 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  32.8 
 
 		 275 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  27.1 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  30.29 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>