50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0630 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  50.88 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  48.19 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  45.83 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  47.27 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  43.16 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  42.76 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  37.72 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  40.5 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  35.53 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  39.26 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  44.62 
 
 		 228 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  45.8 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  40.11 
 
 		 229 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  42.03 
 
 		 203 aa  85.9  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  38.86 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  44.03 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  38.93 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  40.43 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  41.35 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  42.11 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  34.08 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  40.6 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  35.42 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  37.16 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  33.1 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  34.27 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  35 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  35.23 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  37.59 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  34.08 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  30.34 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  30.95 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  32.04 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  30.6 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  33.95 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  33.58 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  30.4 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  32.94 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  32.94 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  32.35 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  34.91 
 
 		 210 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  32.8 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  34.44 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  24.05 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  27.45 
 
 		 167 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>