43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3428 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  96.32 
 
 		 326 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  83.69 
 
 		 325 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  70.48 
 
 		 323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  51.25 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  46.37 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  44.86 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  44.76 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  43.63 
 
 		 296 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  44.68 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  37.23 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  30.35 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  29.96 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  33.91 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  32.34 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  29.3 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  31.11 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  29.21 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  27.8 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  28.62 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  30.32 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  29.38 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  29.71 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  31 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  31.34 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  25.33 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  26.61 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  29.07 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  32.35 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  31.79 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  31.66 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  27.85 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  26.43 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  30.11 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  25.79 
 
 		 239 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  29.94 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  27.8 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  26.02 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>