44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5432 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  90.8 
 
 
262 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  45.22 
 
 
266 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  44.98 
 
 
247 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  47.27 
 
 
275 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  43.84 
 
 
269 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  43.11 
 
 
270 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  49.54 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  44.13 
 
 
284 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  35.57 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  35.03 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  37.78 
 
 
228 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  35.63 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  33.89 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  31.88 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  33.99 
 
 
312 aa  72  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  43.61 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  32.11 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  30.39 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  34.93 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  39.44 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  40.91 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  39.23 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  34.93 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  34.09 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  40.77 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  30.62 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  32.77 
 
 
216 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  36.3 
 
 
278 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  31.42 
 
 
325 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  31.89 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  32.79 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  32.33 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  30.94 
 
 
323 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  29.8 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  30.95 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  30.77 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  31.82 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 
311 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  30.59 
 
 
210 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>