44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1613 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  45.83 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  43.11 
 
 
262 aa  188  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  42.49 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  47.7 
 
 
237 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  41.96 
 
 
266 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  41.46 
 
 
284 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  43.11 
 
 
263 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  42.02 
 
 
269 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  44.12 
 
 
228 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  36.89 
 
 
229 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  40.79 
 
 
247 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  36.79 
 
 
227 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  41.56 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  35.97 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 
203 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  36.67 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  31.58 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  34.13 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  32.09 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  36.99 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  36.43 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  32.24 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  35.12 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  37.34 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  38.69 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  33.9 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  30.72 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  39.22 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  34.88 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  37.59 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  32.41 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  33.76 
 
 
323 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  37.68 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  32.13 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  34.72 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  34.53 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  32.84 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  33.57 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  34.78 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  35.59 
 
 
325 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>