44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5785 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  74.02 
 
 
325 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  74.11 
 
 
326 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  74.38 
 
 
325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  51.39 
 
 
310 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  46.47 
 
 
290 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  44.12 
 
 
297 aa  202  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  47.96 
 
 
307 aa  199  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  42.26 
 
 
296 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  44.66 
 
 
311 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  36.69 
 
 
251 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  34.02 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  34.58 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  31.84 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  29.51 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  30.08 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  33.76 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  29.36 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  29.55 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  29.26 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  30 
 
 
241 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  29.82 
 
 
222 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  34.7 
 
 
216 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  30.4 
 
 
275 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  28.64 
 
 
237 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  29.38 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  27.8 
 
 
239 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  32.18 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  29.65 
 
 
228 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  34.88 
 
 
228 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  29.59 
 
 
240 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  27.78 
 
 
271 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  28.69 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  30.59 
 
 
278 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  25.75 
 
 
248 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  28.86 
 
 
263 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  29.14 
 
 
234 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  29.51 
 
 
218 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  28.65 
 
 
223 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>