45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2811 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  62.96 
 
 
269 aa  345  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  47.06 
 
 
262 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  45.22 
 
 
263 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  40.96 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  42.76 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  42.81 
 
 
284 aa  175  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  45.5 
 
 
237 aa  171  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  41.96 
 
 
270 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  40.62 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  41.18 
 
 
229 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  31.37 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  37.58 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  35.68 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  36.3 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  37.32 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  35.15 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  31.95 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  36.53 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  34.64 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  33.67 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  34.84 
 
 
223 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  33.55 
 
 
320 aa  72  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  35.26 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  32.9 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  39.23 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  32.58 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  30.33 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  32.08 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  32.55 
 
 
326 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  33.96 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  28.63 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  32 
 
 
325 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  31.95 
 
 
251 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  34.32 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  36.5 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  28.65 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  30.94 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  32.47 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  32.59 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  29.63 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  33.57 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>