57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1665 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
228 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  47.74 
 
 
223 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  39.49 
 
 
228 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  45.6 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  41.33 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  33.64 
 
 
271 aa  95.1  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  44.12 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  41.51 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  34.41 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  32.02 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  38.61 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  35.96 
 
 
320 aa  85.1  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  38.35 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  35.98 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  33.53 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  32 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  33.92 
 
 
190 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  36.43 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  32.62 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  29.92 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  32.29 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  31.67 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  30.74 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  36.04 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  32.77 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  34.1 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  31.67 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  31.58 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  34.12 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  30.46 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  29.1 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  32.14 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  31.34 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  31.58 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  31.2 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  30.43 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  36.59 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  32.38 
 
 
310 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  33.99 
 
 
307 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  30.37 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  30.94 
 
 
243 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  37.21 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  31.93 
 
 
297 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 
296 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  30.3 
 
 
239 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 
312 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  29.7 
 
 
290 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  34.12 
 
 
323 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  29.77 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  33.1 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  31.74 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  26.53 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  31.75 
 
 
325 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  31.79 
 
 
325 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  29.23 
 
 
326 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>