26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6381 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  77.37 
 
 		 190 aa  295  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  79.47 
 
 		 190 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  72.88 
 
 		 192 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  58.97 
 
 		 201 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  60 
 
 		 203 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  59.24 
 
 		 204 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  59.56 
 
 		 201 aa  197  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  72.33 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  68.04 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  63.7 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  36.18 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  32.61 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  35.91 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  34.15 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  31.75 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  33.77 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  29.1 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  32.4 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1848  hypothetical protein  29.56 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  31.58 
 
 		 271 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  29.93 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  31.79 
 
 		 320 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  29.86 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  31.82 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>