27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1649 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0698  hypothetical protein  82.7 
 
 		 204 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  77.6 
 
 		 203 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  77.05 
 
 		 201 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  72.13 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  58.82 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  55.98 
 
 		 190 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  61.27 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  63.7 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3652  hypothetical protein  57.59 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2962  hypothetical protein  57.59 
 
 		 196 aa  161  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0898019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  34.51 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  33.9 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  29.5 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  33.96 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  35.9 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  32.74 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  32.03 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  31.43 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  28.86 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1848  hypothetical protein  27.5 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  28.42 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  28.1 
 
 		 320 aa  48.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  28.19 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  32.14 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>