41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5246 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  51.38 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  46.47 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  45.96 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  46.04 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  40.59 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  40.33 
 
 		 307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  43.91 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 		 311 aa  171  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  41.61 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  33.58 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  31.95 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  31.58 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  29.58 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  29.82 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  30.46 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  30.94 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  28.82 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  26.64 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  30.95 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  30.82 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  27.91 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  29.7 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  24.05 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  25.81 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  31.76 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  29.52 
 
 		 234 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  29.94 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  27.04 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  27.94 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  23.81 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  25.86 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  29.48 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  27.32 
 
 		 218 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  24.86 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  24.34 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  30.67 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>