44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1051 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  96.32 
 
 
325 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  84.05 
 
 
325 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  69.33 
 
 
323 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  51.71 
 
 
310 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  45.17 
 
 
290 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  43.93 
 
 
307 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  44.73 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  42.95 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  44.03 
 
 
311 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  36.9 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  36.61 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  34.93 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  29.29 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  32.55 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  30.17 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  30.51 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  28.25 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  28.97 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  29.78 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  31.33 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  31.7 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  29.71 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  26.15 
 
 
241 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  30.88 
 
 
216 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  31.8 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  29.91 
 
 
263 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  29.25 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  31.39 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  25.88 
 
 
237 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  30.4 
 
 
278 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  26.32 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  32.76 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  27.65 
 
 
240 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 
312 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  31.28 
 
 
228 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  28.36 
 
 
234 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  26.13 
 
 
239 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  28.25 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  26.43 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  24.9 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0938  hypothetical protein  28.12 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.919268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 
223 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>