42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1323 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1323  dessication-associated protein  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693322  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  56.76 
 
 
297 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  62.37 
 
 
296 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0097  twin-arginine translocation pathway signal  54.74 
 
 
311 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  46.56 
 
 
310 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  40.33 
 
 
290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  47.96 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1051  hypothetical protein  45.27 
 
 
326 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3428  hypothetical protein  46.71 
 
 
325 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6576  hypothetical protein  46.15 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3704  hypothetical protein  35.64 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  35.2 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  38.03 
 
 
216 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  35.39 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  33.93 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  33.72 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  33.71 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  34.27 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  29.39 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  30.09 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  35.41 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  32 
 
 
241 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  32.74 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  31.82 
 
 
237 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  32.41 
 
 
270 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  28.63 
 
 
266 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  30.95 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  32.83 
 
 
247 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  32.16 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  32.07 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  29.76 
 
 
240 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  29.24 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  27.13 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3504  twin-arginine translocation pathway signal  31.35 
 
 
203 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5422  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817274  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  28.74 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 
228 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  25.43 
 
 
239 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  31.01 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2717  hypothetical protein  31.29 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000628487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>