37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5556 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5556  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2810  hypothetical protein  51.88 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4516  hypothetical protein  49.78 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3240  hypothetical protein  45.53 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1457  hypothetical protein  46.53 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.036624  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1614  hypothetical protein  43.7 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5433  hypothetical protein  44.8 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447331  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  44.44 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1586  hypothetical protein  42.98 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200822  normal  0.0181196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2716  hypothetical protein  37.08 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0285801  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1458  hypothetical protein  42.4 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671711  normal  0.0432371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1613  hypothetical protein  36.67 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3503  twin-arginine translocation pathway signal  31.84 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0630  hypothetical protein  35 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1522  hypothetical protein  33.96 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5421  hypothetical protein  32.87 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4335  hypothetical protein  32.7 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0940  hypothetical protein  30.17 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4517  hypothetical protein  37.7 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1665  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4334  hypothetical protein  38.35 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3241  conserved hypothetical protein, secreted  35.61 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1587  hypothetical protein  32.34 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.0327578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2811  hypothetical protein  32.47 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3167  hypothetical protein  30.54 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.516329  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1666  twin-arginine translocation pathway signal  31.47 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.260278  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04980  conserved hypothetical protein  30.12 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0162  hypothetical protein  28.11 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.390523 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1645  hypothetical protein  35.92 
 
 		 320 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0388574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0623  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.846977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0385  hypothetical protein  30.97 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5555  hypothetical protein  31.17 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  27.72 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5432  conserved hypothetical protein, secreted  32.79 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5785  hypothetical protein  28.69 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150184  hitchhiker  0.00326204 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5246  hypothetical protein  36.84 
 
 		 290 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4137  hypothetical protein  26.49 
 
 		 190 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>