194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1638 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1638  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 462 aa  923    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.298777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2558  FAD dependent oxidoreductase  60.17 
 
 		 452 aa  533  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.958993  normal  0.172468 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0028  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55.7 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.29232  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1882  FAD dependent oxidoreductase  57.2 
 
 		 462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0773  FAD dependent oxidoreductase  57.33 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.37 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.74 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.08 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  30.32 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  30.32 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 395 aa  67  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  21.41 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  29.86 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  29.86 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  29.78 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  30.32 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.75 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  29.33 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  29.33 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  29.33 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  29.33 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.53 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.21 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  30.98 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  28.9 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.44 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  26.32 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  28.89 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.5 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  30.86 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.11 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.89 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  23.61 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.09 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  29.78 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  25.63 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.06 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  22.57 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  28.68 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  26.24 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  21.24 
 
 		 348 aa  54.3  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  26.49 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  26.49 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  26.24 
 
 		 435 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  30 
 
 		 442 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 		 429 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  30.07 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 407 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 382 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  23.6 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.6 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  29.02 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  29.31 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  29.02 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  26.49 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.55 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  29.31 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  25.86 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  29.31 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  29.94 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  24.91 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  29.38 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.38 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.85 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  21.93 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  29.38 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.1 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  23.35 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  27.55 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  29.38 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.17 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>