162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1882 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0028  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  81.64 
 
 
463 aa  743    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.29232  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1882  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
462 aa  931    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2558  FAD dependent oxidoreductase  61.52 
 
 
452 aa  537  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.958993  normal  0.172468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0773  FAD dependent oxidoreductase  60.99 
 
 
455 aa  500  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1638  FAD dependent oxidoreductase  56.99 
 
 
462 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.298777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.52 
 
 
449 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.67 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.67 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  24.09 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.11 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.11 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.35 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  28.52 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  21.7 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  28.84 
 
 
405 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 
453 aa  66.6  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 
455 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 
457 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.73 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 
418 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 
452 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 
423 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
436 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.63 
 
 
379 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 
430 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  27.52 
 
 
395 aa  62.4  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  21.52 
 
 
369 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  21.63 
 
 
408 aa  60.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 
380 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  20.55 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 
393 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.24 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  32.62 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  27.17 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  31.51 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 
452 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 
425 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  26.03 
 
 
428 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 
413 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  24.86 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.47 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 
458 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  21.85 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  26.03 
 
 
428 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  27.35 
 
 
442 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  25.57 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  21.2 
 
 
399 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  25.57 
 
 
428 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  26.15 
 
 
428 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 
380 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.42 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.85 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  24.54 
 
 
428 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  25.81 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 
443 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  30.22 
 
 
431 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 
431 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  21.95 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 
426 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 
429 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  24.07 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  24.07 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  22.47 
 
 
397 aa  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  24.07 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  24.07 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 
380 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.9 
 
 
430 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 
382 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.74 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  24.6 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.58 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  22.7 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 
360 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  20.19 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 
462 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.07 
 
 
455 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  24.07 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.11 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  30.46 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  23.53 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 
396 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  22.07 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.03 
 
 
390 aa  48.5  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>