115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0028 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1882  FAD dependent oxidoreductase  81.64 
 
 
462 aa  717    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0028  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  100 
 
 
463 aa  944    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.29232  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2558  FAD dependent oxidoreductase  57.27 
 
 
452 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.958993  normal  0.172468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0773  FAD dependent oxidoreductase  57.24 
 
 
455 aa  477  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1638  FAD dependent oxidoreductase  55.7 
 
 
462 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.298777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  23.68 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.98 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.45 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.41 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.64 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.29 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.29 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  24.24 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.91 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 
453 aa  66.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 
457 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  21.36 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 
452 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
369 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.7 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 
418 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 
406 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 
407 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.17 
 
 
396 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 
390 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.46 
 
 
390 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  23.17 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 
452 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  21.99 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  24.72 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  21.7 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 
379 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  28.57 
 
 
428 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
413 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  28.11 
 
 
428 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  24.28 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  23.67 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  21.99 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 
458 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  27.65 
 
 
428 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  27.65 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.8 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  27.65 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 
381 aa  53.9  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  22.79 
 
 
386 aa  53.9  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  28.8 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.61 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.73 
 
 
384 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  22.12 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  25.93 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  23.72 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.01 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
430 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  30.64 
 
 
360 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 
462 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  26.51 
 
 
428 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 
459 aa  50.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  26.05 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  26.05 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  26.05 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  26.05 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 
380 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 
375 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  26.05 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 
453 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 
429 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  23.59 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.31 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  20.59 
 
 
402 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.7 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  24.81 
 
 
407 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  25.58 
 
 
428 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 
421 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.81 
 
 
409 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  30.41 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  26.18 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>