More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4236 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4236  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  249  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0776  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0195762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0828  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0824  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0263767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0442  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0489543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 707 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 977 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 984 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3975  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4086  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  30.65 
 
 		 1970 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2756  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3365  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.648544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 1832 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 991 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3451  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.390224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4294  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4072  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 937 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1975  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 937 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 934 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  28.21 
 
 		 2070 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  33.7 
 
 		 888 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 935 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4506  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3973  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.249812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3466  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 970 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1955  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  26.98 
 
 		 1888 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  35.56 
 
 		 998 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  32.18 
 
 		 927 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3003  two component Fis family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 465 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1603  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  0.483504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  31.03 
 
 		 927 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 945 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1201 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 465 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 		 969 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 911 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5999  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 280 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 858 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 928 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1271 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2803  response regulator receiver domain-containing protein  28.32 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3587  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.794363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 1177 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  31.9 
 
 		 971 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  28.81 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2898  response regulator receiver protein  27.43 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1907 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 1127 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.95 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1361 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 2022 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  34.44 
 
 		 934 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2440  response regulator receiver protein  39.56 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  27.12 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  35.56 
 
 		 922 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 2212 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  35 
 
 		 910 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1012  response regulator receiver protein  27.68 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175734  normal  0.0400951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  32.46 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  28.07 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.97 
 
 		 2301 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1572  nitrogen assimilation regulator receiver protein  33.05 
 
 		 471 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181589  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  27.12 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.93 
 
 		 456 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2377  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>