More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2834 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  79.32 
 
 
470 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  74.62 
 
 
463 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  77.61 
 
 
470 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  76.07 
 
 
470 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  70.11 
 
 
500 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  69.21 
 
 
486 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  77.78 
 
 
482 aa  742    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  77.83 
 
 
470 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  78.33 
 
 
470 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  70.19 
 
 
480 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  100 
 
 
495 aa  979    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  70.19 
 
 
479 aa  634    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  74.29 
 
 
465 aa  655    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  78.33 
 
 
470 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  67.93 
 
 
474 aa  625  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  67.9 
 
 
472 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  71.4 
 
 
472 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  71.14 
 
 
476 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  71.34 
 
 
476 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  68.45 
 
 
470 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  70.76 
 
 
481 aa  611  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  71.02 
 
 
484 aa  594  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  71.3 
 
 
485 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  70.92 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  67.31 
 
 
478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
502 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  62.28 
 
 
490 aa  548  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  62.5 
 
 
470 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  62.67 
 
 
464 aa  531  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  61.97 
 
 
472 aa  525  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  61.5 
 
 
486 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  59.48 
 
 
472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  55.14 
 
 
505 aa  508  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  60.89 
 
 
511 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  58.52 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  58.04 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  59.75 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  58.48 
 
 
487 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  54.37 
 
 
477 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  54.58 
 
 
477 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  52.18 
 
 
488 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 
475 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  51.23 
 
 
480 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  48.59 
 
 
476 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  46.3 
 
 
467 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 
478 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  48.21 
 
 
473 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  48.25 
 
 
469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 
463 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  46.24 
 
 
467 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  44.92 
 
 
493 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  47.7 
 
 
472 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
459 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 
466 aa  402  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  45.81 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  51.56 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  45.59 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  47.94 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
463 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  45.49 
 
 
466 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
454 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  45.87 
 
 
467 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
455 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  46.43 
 
 
466 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  47.65 
 
 
463 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  47.1 
 
 
476 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 
460 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  46.41 
 
 
468 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  47.07 
 
 
466 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  47.54 
 
 
463 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 
462 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  45.58 
 
 
458 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  46.98 
 
 
475 aa  385  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  45.93 
 
 
466 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  50 
 
 
468 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  46.53 
 
 
460 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  43.05 
 
 
504 aa  384  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  43.54 
 
 
467 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  41.91 
 
 
466 aa  382  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  46.71 
 
 
463 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  43.05 
 
 
461 aa  382  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  42.02 
 
 
458 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
476 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  46.64 
 
 
505 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  46.14 
 
 
469 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  45.62 
 
 
462 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  44.98 
 
 
456 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  46.12 
 
 
467 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 
471 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  41.44 
 
 
470 aa  377  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  45.84 
 
 
468 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  47.46 
 
 
463 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  43.15 
 
 
459 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  46.55 
 
 
471 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  45.62 
 
 
462 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 
462 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  45.97 
 
 
460 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  42.57 
 
 
460 aa  375  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  45.88 
 
 
488 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>